Шлунково-кишковий тракт – це система, що складається із шлунка та кишечника, яка реалізує просування та всмоктування в кров та лімфу тих поживних речовин, які підготувала система перетравлення та засвоєння їжі для організму. ШКТ має спеціальну анатомічну будову для виконання цієї функції (м'язове волокно для перестальтики, ворсинки для збільшення поверхні всмоктування, залози і т.д.).
Ця система знаходиться в тісному зв'язку з системою перетравлення та засвоєння їжі та з серцево-судинною системою . Якщо їжа в процесі перетравлення недостатньо оброблена ферментами, жовчю або соками, відбувається її залипання і гниття на стінках кишечника і, в кінцевому рахунку, самоотруєння шлаками. Згодом виникають пухлини, поліпи, кісти, новоутворення.
На роботу шлунково-кишкового тракту також впливає наявність паразитарних інвазій – вірусів, грибків, дріжджів, бактерій, глистів у кишечнику. Дуже важливо звернути увагу на оновлення генофонду корисної мікрофлори в шлунково-кишковому тракті, підтримки перестальтики, виведення калових мас з організму.